Solutions Multiomiques

La biologie est complexe. Nous vous aidons à obtenir une vue d'ensemble en combinant des données protéomiques, lipidomiques et métabolomiques.

Obtenez une vue d'ensemble

En tant que scientifiques nous-mêmes, nous comprenons que nous avons parfois besoin d'étudier les choses séparément, de manière bien organisée et ciblée. Ces études étroites nous permettent de construire lentement des réseaux d'interaction, des voies de signalisation et des cascades enzymatiques (salut le cycle de Krebs !), une pièce à la fois, jusqu'à ce que nous obtenions une carte complète des processus biologiques. Une fois cela fait, on peut utiliser ces connaissances en combinaison avec la puissance des sciences omiques pour étudier ses échantillons dans leur ensemble. 


Pendant des années, la génomique et la transcriptomique ont été les méthodes privilégiées pour obtenir une vision globale de la biologie des maladies ou des médicaments qui les traitent. Mais grâce aux récentes avancées technologiques et scientifiques de la spectrométrie de masse, nous pouvons désormais faire bien plus que limiter nos recherches à l'ADN et à l'ARN. L'utilisation de la protéomique, de la lipidomique et de la métabolomique véritablement non ciblées peut en effet vous aider à découvrir des interactions imprévues entre différents types de molécules. Êtes-vous prêt à en savoir plus ?

Construisons un projet ensemble

Les projets multiomiques sont par définition très complexes. Nos experts planifieront d'abord un appel avec vous et votre équipe pour discuter en détail de votre projet. Une fois que nous aurons compris vos objectifs, nous élaborerons un projet qui comprendra toute combinaison de protéomique, lipidomique et/ou métabolomique et le soumettrons à votre approbation. Une fois que nous serons tous d'accord sur le flux de travail, nous passerons à l'étape suivante.

Acquisition des données et première analyse

Grâce à nos spectromètres de masse haut de gamme et à nos connaissances inégalées, nous obtiendrons des informations quantitatives à partir de vos échantillons pour tous les types de molécules requis. Une fois les analyses qualifiées, une première série d'analyses de données sera effectuée pour chaque type de molécules omiques séparément. Cela permet de s'assurer que les données que nous transmettons à l'étape suivante ont été normalisées et passent notre seuil de qualité. À ce stade, nous pouvons déjà inclure des analyses statistiques avancées pour mettre en évidence des caractéristiques intéressantes dans une seule analyse omique.

Analyse multiomique

C'est ici que le plaisir commence ! Les données omiques pré-analysées seront fusionnées à l'aide de flux de travail bioinformatiques avancés. À ce stade, nous pouvons inclure toutes les autres données que vous possédez (comme les métadonnées précédentes ou les études génomiques/transcriptomiques) dans le pool de données et poursuivre l'analyse. Comme nous savons que de nombreux facteurs peuvent fausser les résultats, nous accordons une attention particulière à la normalisation des données. Cela nous aide à réduire le bruit et à fournir des analyses multivariées informatives qui produiront différents groupes ou signatures moléculaires au sein de votre expérience.

Rapport de données

Une fois les analyses terminées, nous regroupons le tout dans un rapport de données complet qui comprend toutes les informations dont vous avez besoin pour comprendre ce qui a été fait. Par exemple, nous fournissons un résumé de l'expérience qui explique les travaux de laboratoire et de spectrométrie de masse effectués, ainsi que les stratégies d'analyse des données utilisées. Ensuite, nous rassemblerons tous les points clés des analyses dans un onglet de résumé des résultats pour que vous puissiez facilement voir les principales conclusions de l'étude. Enfin, les données brutes et analysées individuellement vous seront remises pour une étude plus approfondie (si nécessaire). En outre, nous planifierons un appel pour discuter des résultats avec vous et votre équipe afin que vous puissiez extraire le maximum d'informations du rapport.

Contactez nos scientifiques

Mon expérience personnelle de collaboration avec PhenoSwitch Bioscience a été vraiment étonnante et formidable. Les paralogues des protéines ribosomales présentent un nombre très limité de différences d'acides aminés. Sans PhenoSwitch, il n'aurait pas été possible d'obtenir une identification et une quantification de si haute qualité des protéines ribosomales dupliquées dans la levure. Je leur suis très reconnaissant pour leur persévérance, leur engagement, leur aide et leurs conseils pendant les moments difficiles de l'optimisation. Si vous avez besoin d'utiliser la spectrométrie de masse pour l'identification et la quantification de vos molécules, je vous recommande vivement de vous adresser à eux !

Mustafa Malik Ghulam, Post Doctoral Fellow, RNA Therapeutic Institute, Umass Medical School, Worcester, Massachussetts

"PhenoSwitch Bioscience nous a fourni un service efficace, des données de haute qualité et des analyses de données exemplaires au cours des trois dernières années."

Stephen Naylor, Ph.D., CEO chez ReNeuroGen LCC, Milwaukee, USA

"Ils ont fourni d'excellentes données en un court laps de temps pour un certain nombre d'études sur le métabolisme et les protéines en cours dans mon groupe."

Klaus Klarskov, Ph.D., Professeur à l'Université de Sherbrooke, Canada
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