Séquençage N-Terminal
L'utilisation combinée de modifications chimiques et de spectrométrie de masse permet d'identifier et de séquencer l'extrémité N-Terminale d'une ou de plusieurs protéines présentes dans un échantillon.
L'utilisation combinée de modifications chimiques et de spectrométrie de masse permet d'identifier et de séquencer l'extrémité N-Terminale d'une ou de plusieurs protéines présentes dans un échantillon.
Pourquoi étudier l'extrémité N-Terminale d'une protéine?
Pour avoir lieu, plusieurs processus biologiques nécessitent qu'une modification post-traductionnelle soit effectuée sur une protéine. Par exemple, la majorité des homones peptidiques sont produites sous la forme de pro-hormone et nécessite un clivage protéolytique pour devenir active. Les protocoles qui nous permettent d'identifier l'extrémité N-Terminale d'une protéine deviennent donc très intéressants pour étudier la maturation des hormones, ou de tout autre protéine. En utilisant une combinaison de réactions chimiques, d'enrichissement et de spectrométrie de masse, nous pouvons identifier le "N-Terminome" d'un échantillon. Cette technique peut être utilisée pour identifier l'extrémité N-Terminale d'une seule protéine, ou de toutes les protéines détectables dans l'échantillon.
Protocole général
Pour le séquençage du N-Terminal d'une protéine pure
Le rapport de données inclue la séquence du N-Terminal identifié, en plus des spectres MS et MS/MS. Toute autre information pertinente pourra également être fournie sur demande.
Pour le séquençage du N-Terminal d'un protéome complet
La liste de chaque N-Terminal identifié et confirmé sera fournie, en plus de la séquence. Toute information pertinente pourra également être fournie sur demande.