Services de protéomique quantitative sans étiquette

Explorez la puissance de l'acquisition indépendante des données (DIA), aussi appelée SWATH. Obtenez des données quantitatives pour jusqu'à 6 500 protéines dans vos échantillons avec notre workflow de protéomique quantitative sans étiquette*. 

Le meilleur de la quantification protéomique sans étiquette

Notre équipe de scientifiques a passé le meilleur de ces dernières années à perfectionner notre service de protéomique quantitative sans étiquette. En utilisant une technologie appelée SWATHTM, ou acquisition indépendante des données (DIA), nous pouvons enregistrer et quantifier chaque peptide ionisable de votre échantillon. Ce type d'analyse est parfait pour comparer les protéomes des cellules ou des tissus entre deux ou plusieurs traitements.

Diviser pour régner

La technologie SWATHTM utilise une méthode astucieuse pour tout enregistrer, tout en conservant la possibilité de rechercher facilement les résultats après l'analyse. La clé de cette méthode d'acquisition est une fragmentation de la gamme de masse étudiée en fenêtres plus petites. Chaque peptide qui tombe dans une fenêtre est fragmenté et la machine enregistre sa signature MS/MS. Ensuite, en utilisant une bibliothèque d'ions, nous sommes en mesure de déconvoluer le signal et d'extraire des informations quantitatives pour chaque peptide, au niveau du MS/MS. 

Pour plus d'informations sur SWATHTM, vous pouvez vous référer aux articles de blog et aux vidéos que nous avons produits sur le sujet.

Workflow en SWATH

Rapports de données

Les données des expériences de protéomique quantitative sans marquage seront livrées dans une feuille de calcul. Nous fournirons des statistiques de base telles que la moyenne, l'écart type, le %CV et le fold change pour les comparaisons de groupes. En fonction du nombre de répliques, nous générerons un intervalle de confiance ou un test T de Student pour évaluer la signification. En outre, nous fournirons un onglet de données interactif où vous pourrez visualiser les informations pertinentes pour une protéine donnée. Si nécessaire, nous pouvons également générer des analyses statistiques plus avancées, telles qu'une analyse en composantes principales (ACP), un regroupement par cartes thermiques et une ontologie des gènes. Pour plus d'informations, veuillez vous référer à notre article de blog sur le sujet.

Articles de blog (Version anglaise seulement)

Quantitative proteomics using SWATH: What is it and how it works?

Q&A about SWATH

What you should expect from your proteomics experiments

Vidéos (Version anglaise seulement)

Quantitative SWATH proteomics, why is it better?

*Sur des workflows spécifiques. Certaines conditions s'appliquent.

Contactez-nous pour vos besoins en protéomique quantitative

Mon expérience personnelle de collaboration avec PhenoSwitch Bioscience a été vraiment étonnante et formidable. Les paralogues des protéines ribosomales présentent un nombre très limité de différences d'acides aminés. Sans PhenoSwitch, il n'aurait pas été possible d'obtenir une identification et une quantification de si haute qualité des protéines ribosomales dupliquées dans la levure. Je leur suis très reconnaissant pour leur persévérance, leur engagement, leur aide et leurs conseils pendant les moments difficiles de l'optimisation. Si vous avez besoin d'utiliser la spectrométrie de masse pour l'identification et la quantification de vos molécules, je vous recommande vivement de vous adresser à eux !

Mustafa Malik Ghulam, Post Doctoral Fellow, RNA Therapeutic Institute, Umass Medical School, Worcester, Massachussetts

"PhenoSwitch Bioscience nous a fourni un service efficace, des données de haute qualité et des analyses de données exemplaires au cours des trois dernières années."

Stephen Naylor, Ph.D., CEO chez ReNeuroGen LCC, Milwaukee, USA

"Ils ont fourni d'excellentes données en un court laps de temps pour un certain nombre d'études sur le métabolisme et les protéines en cours dans mon groupe."

Klaus Klarskov, Ph.D., Professeur à l'Université de Sherbrooke, Canada
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