Métabolomique non ciblée Haute Résolution

Établissez le profil de vos échantillons pour les métabolites connus et inconnus.

Explorez les petites molécules - découvrez des tendances inattendues

Le profilage d'échantillons à l'aide de la métabolomique non ciblée est la meilleure technique disponible pour identifier les changements inconnus dans les petites molécules entre les conditions. Comme elle n'est pas ciblée, cette méthode enregistre chaque molécule ionisable de l'échantillon. L'identification des métabolites est effectuée après l'acquisition grâce au mappage des données enregistrées sur une bibliothèque d'ions. Comme toujours, les flux de travail non ciblés sont moins précis et moins sensibles que les flux de travail ciblés, mais leur capacité de profilage est bien supérieure. C'est pourquoi ce type d'expérience est mieux adapté pour explorer toutes les différentes voies métaboliques à la fois, plutôt qu'une seule voie spécifique.

Le fonctionnement

La nature chimique des petites molécules qui sont analysées dans un workflow de métabolomique non ciblé est incroyablement diverse. Cette hétérogénéité signifie que les molécules se comporteront différemment tant sur la colonne de chromatographie que dans le spectromètre de masse. Nous effectuons généralement 4 acquisitions différentes, en utilisant deux chromatographies différentes et deux modes d'ionisation différents pour optimiser le nombre d'identification et de quantification :

Chromatographie RP - Ionisation positive Chromatographie HILIC - Ionisation positive
Chromatographie RP - Ionisation négative Chromatographie HILIC - Ionisation négative

La chromatographie en phase inversée (RP) sépare les molécules en fonction de leur hydrophobie, tandis que la méthode HILIC fonctionne à l'inverse et sépare les molécules en fonction de leur hydrophilie. Le fait de disposer de deux méthodes chromatographiques différentes permet une meilleure séparation des molécules, ce qui se traduit par une meilleure identification. En outre, une molécule qui s'ionise en mode positif ne s'ionisera pas nécessairement en mode négatif. Par conséquent, en utilisant une combinaison de différentes chromatographies et de différents modes d'ionisation, nous maximisons le nombre d'identifications positives et pouvons explorer une plus grande partie du monde des métabolites. 

Rapports de données

Le rapport de données pour la métabolomique non ciblée peut être personnalisé selon vos besoins. Cependant, il comprendra toujours la quantification de toutes les caractéristiques détectées, qu'elles aient été correctement identifiées ou non. Les statistiques de base telles que la moyenne, l'écart-type et le %CV seront également présentées dans le rapport si nécessaire. En outre, des analyses statistiques plus avancées comme l'analyse en composantes principales, l'enrichissement des voies et le regroupement par cartes thermiques peuvent être fournies.

Contactez-nous pour vos besoins en métabolomique non ciblée

Mon expérience personnelle de collaboration avec PhenoSwitch Bioscience a été vraiment étonnante et formidable. Les paralogues des protéines ribosomales présentent un nombre très limité de différences d'acides aminés. Sans PhenoSwitch, il n'aurait pas été possible d'obtenir une identification et une quantification de si haute qualité des protéines ribosomales dupliquées dans la levure. Je leur suis très reconnaissant pour leur persévérance, leur engagement, leur aide et leurs conseils pendant les moments difficiles de l'optimisation. Si vous avez besoin d'utiliser la spectrométrie de masse pour l'identification et la quantification de vos molécules, je vous recommande vivement de vous adresser à eux !

Mustafa Malik Ghulam, Post Doctoral Fellow, RNA Therapeutic Institute, Umass Medical School, Worcester, Massachussetts

"PhenoSwitch Bioscience nous a fourni un service efficace, des données de haute qualité et des analyses de données exemplaires au cours des trois dernières années."

Stephen Naylor, Ph.D., CEO chez ReNeuroGen LCC, Milwaukee, USA

"Ils ont fourni d'excellentes données en un court laps de temps pour un certain nombre d'études sur le métabolisme et les protéines en cours dans mon groupe."

Klaus Klarskov, Ph.D., Professeur à l'Université de Sherbrooke, Canada
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