Identification de partenaires d'interaction protéique

Identifiez et quantifiez les partenaires d'interaction de votre protéine d'intérêt avec la spectrométrie de masse. Parce qu'il existe d'autres moyens que de découper des bandes de gel pour le découvrir!

Interaction de protéines

APMS (purification par affinité couplée à la spectrométrie de masse)

L'utilisation de méthodes de purification par affinité, telles que l'immunoprécipitation, permet d'isoler des complexes protéines dans des échantillons complexes. Il y a quelques années, on devait séparer le complexe immunoprécipité sur un gel de polyacrylamide, colorer les protéines, découper la bande et ensuite procéder à l'identification des partenaires par MS. Aujourd'hui, il est possible d'analyser le complexe en entier par spectrométrie de masse. Une telle analyse nous permet d'identifier toutes les protéines interagissant avec votre protéine d'intérêt en une seule injection.

Vous voulez plus qu'une liste de protéine?

Notre protocole d'APMS est compatible avec notre technologie de protéomique quantitative sans étiquette. Ainsi, au besoin, nous pouvons quantifier toutes les protéines immunoprécipitées relativement à une condition contrôle. Ce genre d'expérience est idéal pour comparer quantitativement toutes les protéines se trouvant en complexe avec votre protéine d'intérêt dans deux conditions ou plus. 

Rapports de données

  • Dans les rapports de données où seule un liste d'interacteurs est requise, nous fournirons un fichier Excel contenant la liste de toutes identifications probables, en plus d'un score et du nombre de peptides associées à chaque protéine. 
  • Pour les protocoles APMS quantitatifs, nous fournirons un fichier Excel interactif rapportant la quantité relative de chaque protéine identifiée pour chaque condition. Des statistiques de base (moyenne, déviation standard, %CV) seront également calculées. Des statistiques avancées (analyse en composantes principales, clustering, ontologie génique) sont disponibles en option.

Contactez-nous pour identifier les partenaires d'interaction d'une protéine connue

"PhenoSwitch Bioscience nous a fourni un service efficace, des données de haute qualité et des analyses de données exemplaires au cours des trois dernières années."

Stephen Naylor, Ph.D., CEO chez ReNeuroGen LCC, Milwaukee, USA

"Ils ont fourni d'excellentes données en un court laps de temps pour un certain nombre d'études sur le métabolisme et les protéines en cours dans mon groupe."

Klaus Klarskov, Ph.D., Professeur à l'Université de Sherbrooke, Canada
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